レポジトリからディレクトリを削除

下記コマンドで消せる。

 git rm -r hoge/
 git rm -r --cached hoge/

前者だとディレクトリ自体も消えます。
後者だとディレクトリは残った上で、インデックスからのみ削除されます。

上のコマンド叩いて git status すると、deleted 状態になっていることが確認出来ます。

git status
# On branch master
# Changes not staged for commit:
#   (use "git add/rm <file>..." to update what will be committed)
#   (use "git checkout -- <file>..." to discard changes in working directory)
#
#       deleted:    hoge/foo
#       deleted:    hoge/bar

あとはいつも通り commit してあげれば OK。

なお、削除したディレクトリを復元はこんな。

git reset

削除時に --cached つけないとディレクトリ自体が消えてしまうので、復元するにはもう一度 checkout しなおす必要があるような。